Berlatar sebelum peristiwa film pertama, kisah ini menyingkap kehidupan Shiki Ryougi sebelum koma panjangnya. Mikiya Kokutou yang baru mengenalnya, perlahan tertarik dengan aura misterius Shiki. Namun di tengah hubungan mereka yang berkembang, terjadi serangkaian pembunuhan mengerikan—dan Shiki justru menjadi sosok yang paling dicurigai.