Mikiya menemukan kasus seorang gadis SMA bernama Azaka, adik perempuannya, yang terlibat dalam fenomena aneh di akademinya. Siswa-siswa mulai kehilangan ingatan secara misterius, dan Shiki dipanggil untuk membantu menyelidiki. Rahasia gelap yang tersembunyi di balik sekolah itu pun terungkap.