Kobato, mantan detektif amatir yang mengalami "wisdom work", ingin hidup tenang dan tanpa masalah—sama seperti teman sekolahnya, Osanai. Mereka berdua bermaksud menjalani hari-hari biasa di SMA. Namun, ketenangan itu terusik ketika kasus misterius dan kejadian aneh terus bermunculan di sekitar mereka. Mampukah mereka benar-benar menjadi "orang biasa"?